rpc error: code = Unknown desc = update out of sequence
Нарушен порядок версий при обновлении сервиса, происходит когда предыдущее обновление было прервано.
Обычно достаточно запустить команду deploy повторно
Error response from daemon: service '[id]' not found
При обновлении сервиса скрипт не может найти сервис по ID. Значит во время обновления сервис был заблокирован по причине превышения лимита дискового хранилища или по другой причине, смотрите уведомления.
Увеличить лимит и запустить команду deploy повторно.
error: [cloud] One user can run only one instance of program at the same time End another instance and try again
Попытка запустить второй экземпляр программы в другом окне
В другом окне браузера или консоли закрыть экземпляр программы, выполняющий команды: deploy, logs или exec.
Если вдруг случилось такое, что вы точно уверены что у вас не открыты окна, но всё равно происходит это. То видимо произошло зависание процесса на сервере. Если это наблюдается и спустя час после инцидента напишите нам.